L’unité de recherche concentre ses forces autour d’enjeux scientifiques collectifs et/ou pluridisciplinaires, en fondant la construction de ses équipes sur trois principes :
- Favoriser l’analyse de thématiques sur le temps long, en transgressant les limites chronologiques régissant traditionnellement les maquettes d’enseignement de l’archéologie et de l’histoire.
- Encourager les interactions disciplinaires entre archéologie, philologie et histoire au sein des équipes chaque fois que la nature d’une opération le permet, tout en développant des programmes transversaux inter-équipes où la confrontation méthodologique tiendra un rôle central.
- Approfondir les collaborations internes et externes entre archéologues et spécialistes des sciences de la nature (archéozoologie, archéoanthropologie, géomorphologie, prospection géophysique, etc), non seulement pour les disciplines où ces liens sont établis depuis longtemps (par exemple en Préhistoire), mais également dans les domaines de recherche où l’adoption de ces méthodes est plus récente (par exemple en archéologie égyptienne).
Ces principes ont abouti à la définition de trois équipes autour des trois grands domaines pour lesquels une compétence forte est reconnue aux chercheurs alsaciens, auxquelles s’ajoute une équipe émergente appelée à combler une importante lacune régionale.