L'UMR, par l'intermédiaire de ses membres, porte trois collections :
- La collection Études d'archéologie et d'histoire ancienne (EAHA) publie des ouvrages sur la littérature, l'histoire et l'archéologie de l'Antiquité orientale, égyptienne, grecque et romaine ;
- Les Cahiers de la Bibliothèque copte (CBC) reflètent les progrès de la recherche sur l’Égypte chrétienne ;
- La collection Collegium Beatus Rhenanus (CBR) publie des travaux d’histoire, de philologie et d'archéologie de l'Antiquité grecque et romaine liés aux activités du Collegium Beatus Rhenanus
La collection Rhin Meuse Moselle (RMM), qui publie des monographies sur l’archéologie du Grand Est, alongtemps été portée par l'UMR mais elle est gérée aujourd'hui par l'Assocation pour la Valorisation de l'Archéologie du Grand-Est.
